Öğrencimiz Halil Tuvan Gezer’in çalışmaları Genome Biology Dergisinde..

Sabancı Üniversitesi Bilgisayar Bilimi ve Mühendisliği Programı öğrencisi Halil Tuvan Gezer, University of California San Diego ile ortak çalışan bir araştırma enstitüsü olan La Jolla Institute’te gerçekleştirdiği yurtdışı yaz stajındaki çalışmaları ile, Genome Biology dergisinde yayınlanan makalenin 2. yazarı oldu.

Sabancı Üniversitesi’ndeki ilk döneminden itibaren akademik çalışmalara katılmaya özen gösterdiğini söyleyen Tuvan, ilgisini çeken araştırma alanlarına sahip öğretim üyelerine mail atıp, araştırma gruplarına dahil olup olamayacağını sorduğunu belirtiyor. Halil Tuvan Gezer ile yaptığımız söyleşiyi aşağıdan okuyabilirsiniz.  

Merhaba, öncelikle bize kendinizden bahseder misin? Bilgisayar Bilimi ve Mühendisliği Programını okumaya ne zaman karar verdin? Sabancı Üniversitesi’nde bu programı seçmenin özel bir sebebi var mıdır?

H.T.G: Merhaba, ismim Tuvan. Sabancı Üniversitesinde dördüncü senemdeyim. Bilgisayar Bilimi ve Mühendisliği Programındayım. Küçük yaşlarımdan itibaren bilgisayarlara ilgi duymama rağmen üniversite sınavı sonucunda başka bir üniversitede alakasız bir bölüm tercih ettim. O bölümün bana göre olmadığına karar verince yatay geçiş yapma kararı aldım ve seçeneklerimi değerlendirdim. Sabancı'da okuyan tanıdıklarım ve dünya üniversite sıralaması gibi kaynaklara baktıktan sonra en iyi seçeneğin Sabancı Üniversitesi olduğuna karar verdim.

2. sınıfın yazında University of California San Diego ile ortak çalışan bir araştırma enstitüsü olan La Jolla Institute’te staj yaptın. Bu süreci bize anlatır mısın? Nasıl karar verdin, hangi başvuruları yapmam gerekti? Stajda ne tür deneyimler elde ettin?

H.T.G: Okuldaki ilk dönemimden itibaren akademik çalışmalara katılmaya özen gösterdim, araştırma alanları ilgimi çeken hocalarıma mail yoluyla ulaşıp araştırma gruplarına dahil olup olamayacağımı sordum. Hocalarımın yönlendirmeleriyle 1. sınıfın yazında okulumuzun düzenlediği PURE (Program for Undergraduate Research) programına katılarak Öznur Taştan'ın araştırmalarına dahil olma fırsatı yakaladım. Yaz sonunda PURE bittikten sonra ise 2. sınıfa hocamın araştırma grubuna dahil olarak devam ettim. 2. sınıfın 2. döneminde yurt dışında bir araştırma stajı yapmak istediğime karar verdim ve hocalarımdan referans isteyerek çeşitli yerlere başvurular yaptım. Avrupa ve Amerika'da farklı yerlerden olumlu geri dönüş aldım ve tercihimi UCSD (University of California San Diego) ile ortak çalışan bir araştırma enstitüsü olan LJI (La Jolla Institute) olarak yaptım. Burada Ferhat Ay hocamın araştırma grubuna dahil oldum.

Yaz boyunca San Diego, La Jolla bölgesindeydim. La Jolla sakin bir tatil bölgesi, ama bir bilim merkezine çevrilmiş UCSD'nin büyük kampüsünün yanı sıra her cadde üzerinde bir araştırma enstitüsü veya Illumina gibi dev tıbbi malzeme üreticisi firmaların merkezleri var. Bir kahve dükkanına girdiğinizde insanları bilimsel makale okurken gördüğünüz bir yer. Böyle bir bölgede gelen çalışma isteği ile geçirilen 3 ayın bana kattıklarının Türkiye'de aynı sürede kazanabileceklerimden çok daha fazla olduğunu düşünüyorum.

Genome Biology dergisinde yayınlanan makaleniz ile ilgili de bilgi verebilir misin? Hangi konuda, hangi çalışmalar sonrasında hazırlandı? Eklemek istediklerin var mı?

H.T.G: LJI'da bulunduğum grubun ana konusu veri işleme teknikleri kullanarak DNA molekülünün 3 boyutlu şeklini araştırmaktı. Basitçe anlatmak gerekirse DNA'yı bir ip gibi düşünürsek ipin iki ucu düz okunduğunda birbirlerine çok uzak görünebilir fakat eğer ipi ortadan katlayıp bu uçları üst üste getirirsek aslında fonksiyonel olarak birbirini yakın, dolayısıyla birbirine etki eden iki bölge olduklarını söyleyebiliriz. Benim görevim gruptaki araştırmalar sonucu çıkarılan bilimsel hipotezlerin programlanmasıydı. Bu şekilde iki tane program yazdık ve birini makaleye çevirdik. Makale uzun incelemeler sonucu prestijli bir dergi olan Genome Biology'de yayınlandı. Makalenin tamamını bu linkten okuyabilirsiniz.

Son olarak, Sabancı Üniversitesinde Bilgisayar Bilimi ve Mühendisliği Programında okumak isteyen öğrencilere neler tavsiye edersin?

H.T.G: Okulumuzu veya bölümü tercih etmeyi düşünen arkadaşlara tavsiyem bir an önce harekete geçip okulun imkanlarından yararlanmaları. Bu staj ve sonrasında yaptıklarımın hepsini daha ilk dönemimden harekete geçmeme ve okulun imkanlarından yararlanmama bağlıyorum. Pandemi dolayısıyla bir çok üniversite online staj imkanları oluşturmaya başladı, bu bir fırsat olabilir. Vize gibi problemler olmadan yurt dışında staj imkanları oluşmuş oldu. Bundan sonra bir süre de iş hayatını tecrübe edip hangi yoldan devam edeceğimi o şekilde seçmek istiyorum.